dimarts, 20 de setembre de 2011


Aquest video parla per si sol i esta en angles perque tot el mon ho pugui entendre.

dimarts, 30 d’agost de 2011

Alternative guide to visit Barcelona

This is my alternative guide to visit Barcelona. Many of my working colleagues have asked me what to do, to eat or to see when they go to Barcelona.  I prepared a list for some of them and I ended up sending this list to many people. So, I thought it was time to upload it to my blog and make it public for all the people. When reading that guide you must take into account that due to working reasons I haven’t been living in Barcelona the last few years. Therefore, I encourage you to add comments and new places that you discovered in your trip to Barcelona! I will try to update the guide from time to time.



The best place for bravas in Barcelona: Not true? Show all edits Not true?
 Write a review -  -
Bar Tomas
Carrer Major de Sarrià, 49
08017 Barcelona

Fuet and llonganisa
Choriso (chorizo in Spanish)
Pa amb tomaquet i pernil
Cloisses a la Marinera
Xipirons (Chipirones)
Ous estrellats (Huevos estrellados) amb pernil, xorizo or foie
Tortilla de patatas
Boquerones and Anxoas
Gambas al ajillo
Montaditos de lomo
Pa amb tomàquet i Pernil (of course!!!)
Queso curado (curated cheese, as much curated as much tasty! )

Beers: Estrella and Moritz
Wine: whatever from Catalonia! ;)

Good place for tapas in the city center! (Close to les Rambles):

Good sandwiches and tapas.
Pl. del Bonsuccés, 1
08001 - Barcelona
El Raval - Ciutat Vella
Tel. 93 302 10 54


I strongly recommend you tapas, seafood, and paella but also let’s write down some dishes…

Xato (a sort of salat with kod)
Esbarginia farcida de carn o tonyina (Berenjena rellenan de carne o atun)
Conill a la brasa amb allioli
Botifarra amb seques (and allioli)
Calçots (large onions grilled in flames)
Dorada al horno
Bacalla a la llauna (kod in the oven)
Espalda de cabrito al horno


Crema catalana (you are not allowed to leave the country before trying it!, it is the law, I am sorry!;) )
Profiteroles con chocolate caliente
Helado de Turron
Music (some nuts with a liquor)
Flam amb nata (crème caramel)


“El Mussol”

In this place you can eat a lot of tradional Catalan food and you have one near to the center, it is a kind of brasserie, and it has really good quality/ price relationship. The french frites and mushrooms next to the meat or fish are really tasty!!! If you are lucky and get to Barcelona within the calçots season you can try them!

Mussol Caspe
Casp, 19
08006 Barcelona
Teléfono: 93 301 76 10

Mussol Diagonal
Av. Diagonal, 488
08006 Barcelona
Teléfono: 93 416 15 53

“La Clara”
La Clara Restaurant
Gran via de les corts Catalanes, 442 08015
Barcelona - Barcelona

“Els 4 gats”

It can be cheap (working days menu) or expensive.
Carrer Montsio 3 bis
Telf. 933024140

It is worth visiting the webpage and the restaurant as well (English version)

“El Xampanyet”

C/Montcada 22 , Barcelona
Telephone: (00 34 93) 319 7003

“Can culleretes”
Really delicious food in an old restaurant
The oldest restaurant of Barcelona and the second oldest one of Spain

Places to visit

Gaudi stuff:

Casa Batlló
P. de Gràcia, 43 Tel. 93 216 03 06 Timetable: Mo-Su: 9-20h.
Except days with programate acts. Closed at 14pm. See Museums.
With a tyled roof and mosaic façade. Gaudí undertook the total remodelling of this existing building. The result was an outside façade representing a party comparable to Carnival. The house is designed with shapes inspired from natural elements.

Casa Milà o "La Pedrera"
Espai Gaudí
Corner between Paseo de Gracia and Provenza.
Visiting hours: Monday-Sunday: 10-20h.
Informaciton: Tel. 93-484 59 95.
Metro: Linea 3 (Diagonal).
Bus: 7,16,17,18, 22, 24, 28
Considered to be the most representative work of Modernism, it has a breathtaking wavy façade of stone and iron balconies.

Park Güell (1900-1904)
Olot, s/n.
Tel. 93-213 04 88
Visiting hours: November to Frebuary: 10 am. - 6 pm.
March and October: 10 am.- 7 pm.
April and September: 10 am. - 8 pm.
May to August : 10 am. - 9 pm.
This is Gaudi"s largest work in Barcelona. It is an area which main aim was to become a british style "garden-city".

Sagrada Familia (1883-1926)
Sagrada Familia Square
Tel. 93-455 02 47 Visiting hours: September - March: 9 am. and 7 pm. April - August: 9 am and 8 pm. In 1883 Gaudi accepted the assignment to continue building temple.

Casa Calvet
Casp, 48
St. Althougt at first sight house does not seem one of Gaudi"s works, a visit to the entrance hall offers uncommon details.


Port Olimpic (good place for swimming in the beach next to the harbor and later have a Paella o Fideua with allioli in one of the Restaurants of the area, I recall one called Roxy that was pretty good).

Barceloneta (Old neighborhood where a lot is going on. I strongly recommend you either to go to one of the bars there to have some tapas or to go to a restaurant facing the sea and have a paella!)

Plaça Catalunya and down to Les Rambles (at the beginning there is the “Canaletes” fountain where we celebrate Barça titles ;) ) (It is cool for a walk and shopping, C/Tallers it is plenty of Music, original clothes and shoes shops.)
Also you have to get into “Mercat de la Boqueria” and pass by Liceu
At the end of Les Rambles you’ll find Colon, then go a bit more down and to the left you will have a nice walk along the sea.

Before Colon have a coffee inside:

El Bosc de les Fades
Pasaje de la Banca,
Barcelona, 08002

Plaça Sant Jaume and the surroundings
Cathedral and the surroundings
Plaça Reial
El Barri Gòtic
http://www.bcn-guide.com/htm/ang/paseando.htm (pretty nice walk the one they propose!)

Santa Maria del Mar and Born neighborhood (http://www.barcelona-tourist-guide.com/en/areas/el-born.html) (Very cool for some beers, coffee or just a walk)

That’s a pretty relaxing place for some beers!

C/ Rec, 49
08003 Barcelona
932 682 389

Rambla del Raval and surroundings (it is a quite fashion place nowadays, even though you should watch out a bit here with the pickpockets)
Some bars here:

“El Sifo”
Espalter, 4

Bar Marsella (it is supposed to be the oldest bar in Barcelona , to be honest I doubt it ???)
C/ Sant Pau 65
93 318 53 47

“Barri de Gracia”
This is like a small village inside Barcelona, you will notice the different atmosphere. You can find a lot of cafes and bars for a coffee or beer.

Passeig de Gracia
It is like 5th Avenue in New York (well being really enthusiastic!). It is worth having a walk to get to the Barri de Gracia or the other way around to Pl Catalunya. But to be honest it is not worth buying anything there, all is really expensive!

Museo Picasso

Arc de triomf and walk until Parc de la Ciutadella

Mercat de Sant Antoni (frutes, vegetables, seafood with less tourists ;) )
Also good “tapas” bars. On Sundays people exchange stuff. Read more at:

Camp Nou!!!
It is not really beautiful from outside, but maybe you can get to the museum and the shop!
Avinguda Aristides Maillol, s/n, 08028, Barcelona

But to be honest it is not worth going to see the stadium from outside unless you have tickets for a match. If you simply want to buy a T-shirt you can find it in some shops in the center, specially in the officially dedicated to Barça. There is one close to Pl Catalunya if I remember correctly.


Avinguda Portal del Angel (whatever)

C/ Pelai (whatever)

C/Tallers (music, clothes, shoes)

Cool clothes (at a reasonable price):
Skunkfunk · Barcelona - Outlet
Ronda Sant Pere, 31
08010 Barcelona
Tel.: +34 934120223

Desigual (colorful clothes, many shops in the center and inside big commercial centers)

Custo Barcelona (shop in C/ Ferran in the city center, not my favourite style, but very original and  colorful clothes)

El corte ingles (big commercial center nearby Plaça Catalunya)

dimecres, 1 de desembre de 2010

5 a 0

El dilluns vam viure un dels grans partits de futbol que nomes es veuen un cop durant anys, el que passa es que el Barça d'en Guardiola ens esta fent acostumar a aquest tipus de partits. El Barça va jugar en curt, va moure la pilota d'una banda a l'altre i de davant cap enrere, sense deixar-li ensumar la pilota al Madrid. Hi ha la ja famosa jugada del segon gol, on els jugadors toquen la pilota 21 vegades en 58 segons abans de fer-li el segon a l'amic Casillas. El Barça va jugar amb una increible precisio, va pressionar i robar la pilota als defenses i va mantenir el to i la intensitat durant els 90 minuts. Poques vegades haurem vist un equip jugant amb aquesta intensitat, aquesta precisio i amb aquesta creativitat durant tot el partit contra un dels pitjors, sino el pitjor, enemic. Aixo es lo realment impresionat del partit, no els cinc gols, no perque fos el Madrid. Disfrutem tots els anys que aixo duri, perque ja sabem que el futbol va per cicles. Ara estem en el cicle bo del que es possiblement el millor equip de futbol dels ultims temps. Esperem que els tecnics, directius i nosaltres mateixos deixem fluir aquest Barça perque hi ha jugadors a la casa amb molt de futur, un estil definit i una estructura de club.

Un cop he parlat de futbol, comencem a parlar del circ que rodeja aquest esport. Malgrat la meva passio pel futbol i el Barça, que es veu reflectida en moltes ocasions en aquest blog, haig de reconeixer que es potser un dels esports envoltats de mes situacions, personatges i actituds esperpentiques. Quan juntes soberbia, prepotencia, mala educacio tens lo que, malhauradament, es avui el Madrid: Mourinho, Ronaldo, Sergio Ramos, Pepe o Valdano i Florentino, i queden difuminats lo que hauria de ser el Madrid: Casillas, Xabi Alonso, Ozil, etc... La porqueria que s'ha estat venent des de la premsa de Madrid, des d'aquests debats feixistes (Telemadrid, Intereconimia, etc...) on apareix gent,  la qual dubto que tinguin suficient educacio i coneixement per saber lo que estant dient, se l'estant ara menjant amb patates. Tota la pressio extra esportiva que estan intentant posar sobre les espatlles del Barça, els hi hem tornat on es parla realment de futbol, al camp de futbol! Ara, aviam com expliquen que s'han estimbat, que la cortina de fum s'ha esvait, que el crit i la xuleria ha fracasat. I mes important, que tot allo que els representa ara mateixa ha quedat tocat i humiliat. I que consti que no es l'equip de futbol el que queda humiliat, els que hem practicat algun esport sabem que a vegades reps 5 i a vegades en fas 5 de gols. D'un partit a l'altre tot pot variar molt. Els que queden en evidencia son tots aquells que fomenten i alimenten la soberbia i la prepotencia, els que no saben demanar mai disculpes (Mourinho, Ronaldo, Sergio Ramos, Valdano...), ni acceptar raonaments sensats i que al contrari justifiquen qualsevol tipus de comentari o actitud.

Per cert, a vegades quan s'afavoreix Barça o Madrid no es senyalant un penalty en una area que no ho era. Aixo es consequencia nomes de que Barça i Madrid trepitjen l'area mes sovint que altres equips. Encara que hi ha una gran diferencia, fins i tot historica, entre lo que el Barça es afavorit i lo que el Madrid es afavorit. Nomes cal veure el numero de penals assenyalats a favor de cada equip aquesta temporada. Pero aixo es una altre historia que mereixeria un post apart. On realment s'afavoreix als equips es sancionant a Ramos nomes amb un partit despres del que va fer dilluns i va veure tota Espanya. Patada a Messi mes agressio a Puyol i Xavi, que en teoria son companys de seleccio. Aixo senyors de la federacio de futbol no es nomes un partit de sancio (que es lo que normalment reps per una tarjeta vermella directa), aixo son alguns mes, sobretot si tens en compte que Quique Sanchez Flores (entrenador del At. Madrid) ha rebut una sancio de dos partits per una picabaralla al final del partit contra l'espanyol.

En definitiva cules a disfrutar de la victoria i de que la caverna mediatica madrilenya i espanyola esta ben fotuda i humiliada, la qual quan conve critiquen fins i tot a Xavi per estar lesionat, un jugador que els hi ha donat una Copa del mon! Ara es temps de gaudir el que estem vivint i seguir ignorant els atacs des de Madrid, com molt be fa en Guardiola! Aqui us deixo el link de les millors jugades del partit perque ho seguim disfrutant:

dimarts, 6 de juliol de 2010

Vigileu amb els miratges

Es molt facil aquests dies caure en el parany. A la seleccio espanyola de futbol hi juguen actualment 8 jugadors del Barça (Busquests, Puyol, Xavi, Pique, Valdes, Pedro, Villa i Iniesta) i 7 catalans si no vaig errat. Les seves raons mes o menys comprensibles tindran per lluir la samarreta d'Espanya. A mes aquesta seleccio te un clar segell cule, sobretot en lo que es refereix a futbol espectacular d'atac, en companyerisme, en lo que a fer pinya es refereix i en ambicio. Hi han hagut bons moments de la seleccio espanyola en el Mundial, especialment tot i que a molts madridstes i exmadridistes (Hierro) els pesi, quan Espanya ha jugat al estil Barça. Aquests jugadors que representen avui a Espanya han sigut criticats i atacats per la prensa madrilenya durant tot l'any passat. Un cop mes l'anomenada caverna mediatica madridista i espanyola va intentar desestabilitzar els jugadors eterns rivals del seu estimat Madrid. Quan per joc no arriven, com ha passat en els darrers anys, la prensa engega una campanya de pressio per intentar desestabilitzar el contrari i adulterar la competicio influint en la feina dels arbitres. Tot aixo passava nomes fa uns mesos. No ens deixem enganyar pels miratges...fa calor, no hi ha Barça i veiem que en Xavi i companyia segueixen fent meravelles amb la pilota. Pero, amb quina samarreta?

Doncs amb la samarreta de un pais que retalla l'estatut d'autonmia de la nostra nacio, que retalla les nostres llibertats i que voldria veure com la nostra llengua desapareix progressivament sense fer massa soroll. No ens han deixat tenir ni un estatut que, en si mateix, ja era de minims, ja va ser retallat. Que s'ha retocat de l'estatut? Les parts que fan referencia a la llengua, al finançament, a la possibilitat de fer referendums per preguntar al poble que vol fer amb el seu pais. Arreu del mon hi ha clars casos de nacions encaixades dins altres estats mitjançant acords que respecten les llibertats dels diferents sentiments de pais. Per posar exemples veieu el documental de TV3 de fa pocs dies, el cas de Groenlandia i Dinamarca, de Escocia i Anglaterra o del Quebec i Canada. Tots poden parlar lliurament la seva llengua en totes les institucions del seu pais i en qualsevol moment tenen la llibertat de preguntar en referendum a la poblacio si volen independitzar-se. Aixo son paisos moderns, amb politiques modernes que han evolucionat. Espanya es tot lo contrari i estigui qui estigui al govern seguiran igual. La mentalitat tancada, retrograda i nacionalista del seu govern no cambiara mai, perque en el veritable fons Espanya segueix sent un Estat inmobilista i feixista.

Dit aixo si Espanya juga millor que tots els altres i guanya, felicitats! Pero nosaltres els catalans no ens deixem enganyar pels miratges de l'estiu. Per nosaltres els catalans el dissabte a la manifestacio es on es juga la nostra lliga. El dissabte a Barcelona es on tenim que començar a dir prou i volem el dret a decidir per nosaltres mateixos.

dimecres, 12 de maig de 2010

10 maig 2010

Aquest silenci
Miquel Martí i Pol
La Tarda molt intensa m' ha portat
aquest capvespre plàcid.
Reposo els ulls cansats
en l' ordre dels prestatges plens de llibres,
en l'ordre de la cambra.

Es fa fosc lentament, s' encenen llums,
i és més pausat el batec de la vida.

Estimo aquest silenci i aquesta hora
i més ara que em gronxa fins perdre'm
en el record de tu
que mai no m'abandona

dijous, 29 d’abril de 2010

El somni continua!

Avui tornarem a parlar del Barça, precisament despres de la destrempera d'ahir. Aquests dos anys hem gaudit d'un dels millors equips de tots els temps. I crec fermament que en podem seguir gaudint gracies al gran bloc que tenim. Espero que les eleccions possin al capdevant algu que deixi fer en Guardiola i el seu equip. Nomes calen 4 retocs, perque sempre es pot millorar. Pero avui no es dia per entrar en valoracions tecniques. Avui es un dia per anar superant la tristesa lentament i aixecar-se i sobretot estar al costat d'un equip que se m'en refot si guanya algo aquesta temporada o no. Malhauradament, nomes quan hi ha exits es recorda el col.lectiu huma que ha estat darrere de l'exit. Pero aquest es un equip que dona plaer visual als que ens agrada el futbol i et fa sentir orgullos fora dels camps de futbol. Es elegant amb la pilota als peus i en les formes i aixeca passions.

Un equiq amb una filosofia propia, un estil propi i engrescador i un "seny i rauxa" catalans que molt be ha sapigut reforçar en Pep Guardiola. Un equip que ha anat mes enlla, i fins i tot, s'ha atrevit a canviar la historia. Dos grans victories seguides al Bernabeu, totes dues amb lliço de futbol incluida, guanyar tot lo que jugaven l'any passat, i la demostracio que no nomes amb diners es fa tot han provocat que aquella famosa "madriditis" que deien que patiem ara es digui "barcelonitis" i la pateixin a Madrid. M'enorgulleix encara mes que en aquesta ciutat nomes facin que parlar del Barça i esperin a que perdem per celebrar alguna cosa. Pobrets d'anima que sera lo darrer que celebrin aquest any!

Tot i que amb un altre arbitre en el partit d'anada encara seriem a la Champions, tant se val, el barcelonista ha deixat de preocupar-se de l'arbitre. Perdem, felicitem al rival i ens aixequem per seguir vius an altres competicions i al costat del nostre equip. Ens preocupem de jugar be, d'agradar, d'apropar-nos a l'essencia del futbol i que fins i tot el rival ens aplaudeixi. Deixem la bruticia, els descredits i les barbaritats varies per la prensa madrilenya i els Mourinhos de torn, ells es posen en evidencia per si sols. M'enorgulleix que ahir es fessin servir fins a 9 jugadors crescuts a can Barça en una semifinal de la Champions, que el Barça anes a Milan, a Londres, a Stuttgart i a on faci falta a jugar a futbol, i que mai planti un autobus davant de la porteria. Vaig trobar digne d'admirar la fredor d'en Pep quan en Mourinho intentava provocar-lo, la elegancia dels jugadors del Barça i la il.lusio i entrega de l'aficio. Ahir no podia estar al camp, pero part del meu cor cule i la meva sang catalana hi eren aixecant una de les cartulines d'un increible mosaic. Tot i que costi mes, m'agrada que quan el Barça arriva a les finals sigui per futbol, per grans jugades i per grans futbolistes com Iniesta, Messi, Xavi, Pique, Puyol, Valdes...etc..., no per tacticismes avorrits, resultadismes, trucs deshonestos o violencia exagerada. Pero, realment en el futbol d'avui en dia i en moltes altres coses primen els resultats. Els cules romantics que quedem nomes ens queda seguir gaudint amb el nostre equip i el seu bon joc. I a vegades aixo ens permet arrivar a finals, pero a vegades ens deixa a mig cami per ser fidels al nostre estil.

No tingueu dubte que aquest equip es tornara aixecar, tornara a jugar a futbol i ens seguirem sentint orgullosos. Perque com diu l'himne ... tenim un nom i el sap tothom arreu del mon!

divendres, 12 de març de 2010

Markov clustering and the case of the unsupported protein complexes

Aqui ve el tercer capitol sobre com pot actuar el algoritme MCL alhora de construir complexes proteics entre proteines que s'han copurificat conjuntament.

Com en els dos posts anteriors podeu trobar l'entrada original a Buried treasure.

In 2006, Krogan and coworkers published a paper in Nature describing a global analysis of protein complexes in budding yeast. This resulted in a network of 7,123 protein-protein interactions involving 2,708 proteins, which was organized into 547 protein complexes using the Markov clustering algorithm.

Considering my previous two posts, it probably comes as a surprise to nobody that I wanted to check if the issue of unnatural clusters also affected this study. Albert Palleja, a postdoc in my group, thus extracted the 547 sub-networks corresponding the protein complexes and applied single-linkage clustering to check if all clusters corresponded to connected sub-networks.

It turned out that 9 of the 547 protein complexes do not correspond to connected sub-networks in the protein interaction network that formed the basis for the clustering. Two complexes each contain two additional subunits that have no interactions with any of the other subunits of the proposed complex, five complexes contain one additional subunit with no interactions to other subunits, and two complexes are proposed hetero-dimers made up of subunits that do not interact according to the interaction network. These complexes are visualized in the figure below with the erroneous subunits highlighted in red:

To check if these additional subunits are in any way supported by the experimental data presented in the paper, I downloaded the set of raw purification from the Krogan Lab Interactome Database. For 4 of the 9 complexes, the additional subunits are weakly supported by at least one purification. It should be noted, however, that this evidence was not judged to be sufficiently reliable by the authors themselves to include the interaction in the core network based on which the complexes were derived.

To make a long story short, this analysis shows that 9 of the 547 protein complexes published by Krogan and coworkers contain one or more subunits that are not supported by the interaction network from which the complexes were derived. Of these, 5 complexes contain subunits that have no support in the underlying experimental data, and which are purely artifacts of using the MCL algorithm without without enforcing that clusters must correspond to connected sub-networks.


Buried treasure